FoudationONEとNCCオンコパネルの検査対象遺伝子
日本でプロファイリング検査として承認されている
FoundationOne CDx
および
OncoGuide™ NCCオンコパネルシステム
で検査できる遺伝子をまとめました。
FoundationONEはこれらに加え、TMBおよびMSIが調べられます。
| FoundationOne CDx |
OncoGuide™ NCCオンコパネルシステム |
||
| 塩基置換、挿入/欠失、及びコピー数異常（全エクソン） | 遺伝子融合 | 遺伝子変異、増幅 | 遺伝子融合 |
| ABL1 | ALK イントロン18,19 | ABL1 | AKT2 |
| ACVR1B | BCL2 3’UTR | ACTN4 | ALK |
| AKT1 | BCR イントロン8,13,14 | AKT1 | BRAF |
| AKT2 | BRAF イントロン7-10 | AKT2 | ERBB4 |
| AKT3 | BRCA1 イントロン2,7,8,12,16,19,20 | AKT3 | FGFR2 |
| ALK | BRCA2 イントロン2 | ALK | FGFR3 |
| ALOX12B | CD74 イントロン6-8 | APC | NRG1 |
| AMER1 | EGFR イントロン7,15,24-27 | ARAF | NTRK1 |
| APC | ETV4 イントロン8 | ARID1A | NTRK2 |
| AR | ETV5 イントロン6,7 | ARID2 | PDGFRA |
| ARAF | ETV6 イントロン5,6 | ATM | RET |
| ARFRP1 | EWSR1 イントロン7-13 | AXIN1 | ROS1 |
| ARID1A | EZR イントロン9-11 | AXL | |
| ASXL1 | FGFR1 イントロン1,5,17 | BAP1 | |
| ATM | FGFR2 イントロン1,17 | BARD1 | |
| ATR | FGFR3 イントロン17 | BCL2L11/BIM | |
| ATRX | KIT イントロン16 | BRAF | |
| AURKA | KMT2A(MLL) イントロン6-11 | BRCA1 | |
| AURKB | MSH2 イントロン5 | BRCA2 | |
| AXIN1 | MYB イントロン14 | CCND1 | |
| AXL | MYC イントロン1 | CD274/PD-L1 | |
| BAP1 | NOTCH2 イントロン26 | CDK4 | |
| BARD1 | NTRK1 イントロン8-11 | CDKN2A | |
| BCL2 | NTRK2 イントロン12 | CHEK2 | |
| BCL2L1 | NUTM1 イントロン1 | CREBBP | |
| BCL2L2 | PDGFRA イントロン7,9,11 | CRKL | |
| BCL6 | RAF1 イントロン4-8 | CTNNB1/b-catenin | |
| BCOR | RARA イントロン2 | CUL3 | |
| BCORL1 | RET イントロン7-11 | DDR2 | |
| BRAF | ROS1 イントロン31-35 | EGFR | |
| BRCA1 | RSPO2 イントロン1 | ENO1 | |
| BRCA2 | SDC4 イントロン2 | EP300 | |
| BRD4 | SLC34A2 イントロン4 | ERBB2/HER2 | |
| BRIP1 | TERC ノンコーディングRNA | ERBB3 | |
| BTG1 | TERT プロモーター | ERBB4 | |
| BTG2 | TMPRSS2 イントロン1-3 | ESR1/ER | |
| BTK | EZH2 | ||
| C11orf30 | FBXW7 | ||
| CALR | FGFR1 | ||
| CARD11 | FGFR2 | ||
| CASP8 | FGFR3 | ||
| CBFB | FGFR4 | ||
| CBL | FLT3 | ||
| CCND1 | GNA11 | ||
| CCND2 | GNAQ | ||
| CCND3 | GNAS | ||
| CCNE1 | HRAS | ||
| CD22 | IDH1 | ||
| CD274 | IDH2 | ||
| CD70 | IGF1R | ||
| CD79A | IGF2 | ||
| CD79B | IL7R | ||
| CDC73 | JAK1 | ||
| CDH1 | JAK2 | ||
| CDK12 | JAK3 | ||
| CDK4 | KDM6A/UTX | ||
| CDK6 | KEAP1 | ||
| CDK8 | KIT | ||
| CDKN1A | KRAS | ||
| CDKN1B | MAP2K1/MEK1 | ||
| CDKN2A | MAP2K2/MEK2 | ||
| CDKN2B | MAP2K4 | ||
| CDKN2C | MAP3K1 | ||
| CEBPA | MAP3K4 | ||
| CHEK1 | MDM2 | ||
| CHEK2 | MDM4 | ||
| CIC | MET | ||
| CREBBP | MLH1 | ||
| CRKL | MSH2 | ||
| CSF1R | MTOR | ||
| CSF3R | MYC | ||
| CTCF | MYCN | ||
| CTNNA1 | NF1 | ||
| CTNNB1 | NFE2L2/Nrf2 | ||
| CUL3 | NOTCH1 | ||
| CUL4A | NOTCH2 | ||
| CXCR4 | NOTCH3 | ||
| CYP17A1 | NRAS | ||
| DAXX | NRG1 | ||
| DDR1 | NT5C2 | ||
| DDR2 | NTRK1 | ||
| DIS3 | NTRK2 | ||
| DNMT3A | NTRK3 | ||
| DOT1L | PALB2 | ||
| EED | PBRM1 | ||
| EGFR | PDGFRA | ||
| EP300 | PDGFRB | ||
| EPHA3 | PIK3CA | ||
| EPHB1 | PIK3R1 | ||
| EPHB4 | PIK3R2 | ||
| ERBB2 | POLD1 | ||
| ERBB3 | POLE | ||
| ERBB4 | PRKCI | ||
| ERCC4 | PTCH1 | ||
| ERG | PTEN | ||
| ERRFI1 | RAC1 | ||
| ESR1 | RAC2 | ||
| EZH2 | RAD51C | ||
| FAM46C | RAF1/CRAF | ||
| FANCA | RB1 | ||
| FANCC | RET | ||
| FANCG | RHOA | ||
| FANCL | ROS1 | ||
| FAS | SETBP1 | ||
| FBXW7 | SETD2 | ||
| FGF10 | SMAD4 | ||
| FGF12 | SMARCA4/BRG1 | ||
| FGF14 | SMARCB1 | ||
| FGF19 | SMO | ||
| FGF23 | STAT3 | ||
| FGF3 | STK11/LKB1 | ||
| FGF4 | TP53 | ||
| FGF6 | TSC1 | ||
| FGFR1 | VHL | ||
| FGFR2 | |||
| FGFR3 | |||
| FGFR4 | |||
| FH | |||
| FLCN | |||
| FLT1 | |||
| FLT3 | |||
| FOXL2 | |||
| FUBP1 | |||
| GABRA6 | |||
| GATA3 | |||
| GATA4 | |||
| GATA6 | |||
| GID4(C17orf39) | |||
| GNA11 | |||
| GNA13 | |||
| GNAQ | |||
| GNAS | |||
| GRM3 | |||
| GSK3B | |||
| H3F3A | |||
| HDAC1 | |||
| HGF | |||
| HNF1A | |||
| HRAS | |||
| HSD3B1 | |||
| ID3 | |||
| IDH1 | |||
| IDH2 | |||
| IGF1R | |||
| IKBKE | |||
| IKZF1 | |||
| INPP4B | |||
| IRF2 | |||
| IRF4 | |||
| IRS2 | |||
| JAK1 | |||
| JAK2 | |||
| JAK3 | |||
| JUN | |||
| KDM5A | |||
| KDM5C | |||
| KDM6A | |||
| KDR | |||
| KEAP1 | |||
| KEL | |||
| KIT | |||
| KLHL6 | |||
| KMT2A(MLL) | |||
| KMT2D(MLL2) | |||
| KRAS | |||
| LTK | |||
| LYN | |||
| MAF | |||
| MAP2K1 | |||
| MAP2K2 | |||
| MAP2K4 | |||
| MAP3K1 | |||
| MAP3K13 | |||
| MAPK1 | |||
| MCL1 | |||
| MDM2 | |||
| MDM4 | |||
| MED12 | |||
| MEF2B | |||
| MEN1 | |||
| MERTK | |||
| MET | |||
| MITF | |||
| MKNK1 | |||
| MLH1 | |||
| MPL | |||
| MRE11A | |||
| MSH2 | |||
| MSH3 | |||
| MSH6 | |||
| MST1R | |||
| MTAP | |||
| MTOR | |||
| MUTYH | |||
| MYC | |||
| MYCL | |||
| MYCN | |||
| MYD88 | |||
| NBN | |||
| NF1 | |||
| NF2 | |||
| NFE2L2 | |||
| NFKBIA | |||
| NKX2-1 | |||
| NOTCH1 | |||
| NOTCH2 | |||
| NOTCH3 | |||
| NPM1 | |||
| NRAS | |||
| NT5C2 | |||
| NTRK1 | |||
| NTRK2 | |||
| NTRK3 | |||
| P2RY8 | |||
| PALB2 | |||
| PARK2 | |||
| PARP1 | |||
| PARP2 | |||
| PARP3 | |||
| PAX5 | |||
| PBRM1 | |||
| PDCD1 | |||
| PDCD1L | |||
| G2 | |||
| PDGFRA | |||
| PDGFRB | |||
| PDK1 | |||
| PIK3C2B | |||
| PIK3C2G | |||
| PIK3CA | |||
| PIK3CB | |||
| PIK3R1 | |||
| PIM1 | |||
| PMS2 | |||
| POLD1 | |||
| POLE | |||
| PPARG | |||
| PPP2R1A | |||
| PPP2R2A | |||
| PRDM1 | |||
| PRKAR1A | |||
| PRKCI | |||
| PTCH1 | |||
| PTEN | |||
| PTPN11 | |||
| PTPRO | |||
| QKI | |||
| RAC1 | |||
| RAD21 | |||
| RAD51 | |||
| RAD51B | |||
| RAD51C | |||
| RAD51D | |||
| RAD52 | |||
| RAD54L | |||
| RAF1 | |||
| RARA | |||
| RB1 | |||
| RBM10 | |||
| REL | |||
| RET | |||
| RICTOR | |||
| RNF43 | |||
| ROS1 | |||
| RPTOR | |||
| SDHA | |||
| SDHB | |||
| SDHC | |||
| SDHD | |||
| SETD2 | |||
| SF3B1 | |||
| SGK1 | |||
| SMAD2 | |||
| SMAD4 | |||
| SMARCA4 | |||
| SMARCB1 | |||
| SMO | |||
| SNCAIP | |||
| SOCS1 | |||
| SOX2 | |||
| SOX9 | |||
| SPEN | |||
| SPOP | |||
| SRC | |||
| STAG2 | |||
| STAT3 | |||
| STK11 | |||
| SUFU | |||
| SYK | |||
| TBX3 | |||
| TEK | |||
| TET2 | |||
| TGFBR2 | |||
| TIPARP | |||
| TNFAIP3 | |||
| TNFRSF14 | |||
| TP53 | |||
| TSC1 | |||
| TSC2 | |||
| TYRO3 | |||
| U2AF1 | |||
| VEGFA | |||
| VHL | |||
| WHSC1 | |||
| WHSC1L1 | |||
| WT1 | |||
| XPO1 | |||
| XRCC2 | |||
| ZNF217 | |||
| ZNF703 | |||
引用は、FoundationONEはhttps://chugai-pharm.jp/pr/npr/f1t/prd/gene/
NCCオンコパネルはhttp://www.info.pmda.go.jp/downfiles/md/PDF/480585/480585_23000BZX00398000_A_01_01.pdf
になります。
ちなみにCOIはありません。
